Текст написан четким, аккуратным почерком, что сложно осуществить на столь тонком пергаменте - писал его человек, по всей видимости, грамотный. И хотя содержание книги - неизвестно науке, всё же можно с точностью говорить о наличии в ней структуры и деления на разделы.
Всего глав в рукописи Войнича насчитывается шесть, каждая из них имеет четкую тематическую направленность. Раздел «ботанический» украшен картинками, изображающими растения. Структура раздел похожа на справочник, ведь рисунок обязательно сопровождает пара строчек текста. Увидев круговые диаграммы и изображения Солнца и звезд, вы сможете понять, что находитесь в «астрономическом» разделе.Немного жутковато выглядит следующая глава рукописи, под названием «биологическая»: она представляет собою текст, переплетающийся с изображениями пищеварительной системы человека, нарисованными от руки. Кроме того, в нем есть иллюстрации обнаженных девушек пышной красоты.
Далее - раздел под названием «космологический» с не совсем понятными рисунками и вложением, на котором изображена карта или что-то вроде неё. Пятая глава - «фармакологическая», текст которой сопровождается изображениями всё тех же трав и колб. А последний раздел, судя по структуре, состоит из множества рецептов - потому и носит соответствующее название - «рецептный».
Следует сразу отметить, что особой художественностью иллюстрации не отличались и изначально были выполнены в черно-белом варианте, и лишь потом из «разукрасили», причем сделали это неаккуратно и небрежно.
Все эти разделы представляют огромный научный интерес, но все же куда более интересным является текст рукописи Войнича.
Непонятно: на каком языке он написан, естественен ли язык, каков состав лексики. Ясно немногое: последняя была не весьма разнообразна, ведь часто одинаковые слова в тексте повторялись один за другим, а иногда различались только одной буквой. В алфавите было не более 20 букв. Язык рукописи не имел в своем арсенале слов короче трех букв, не отличался обилием знаков препинания. В общем, был слегка «суховат».